针对您提出的关于女朋友服用紧急避孕药后第二个月怀孕对胎儿是否有影响的问题，多位专家给出了自己的解答。大部分专家认为，从优生的角度来看，一般建议受孕前三个月不要用药，因为药物可能会对胚胎产生一定影响。针对紧急避孕药，有专家表示此药不增加胎儿的畸形率。
对于您女朋友的情况，不同专家给出了不同的看法。有的专家认为，如果吃完药后已经来过月经，然后第二次月经时才怀孕，影响会相对小一些。但也有专家认为，避孕药含有激素，一般需要三个月或半年后再受孕较为安全。不过也有专家认为，您的情况对胎儿的影响相对较小，可以考虑保留胎儿，但是必须定期进行孕检，以确保胎儿健康。
关于畸形率的问题，各位专家的回答略有不同。有专家表示没有大样本的调查来确切说明畸形率，但也有专家指出，畸形的发生是极少数的一部分，大部分还是正常的。如果您非常想要这个宝宝，专家建议认真做好产检，如孕22-26周时进行四维彩超排畸。
具体情况还需要根据您女朋友的身体状况和胎儿的发育情况来判断。如果您仍然担心，建议咨询医生并进行详细的检查。请您放心，大部分专家都认为这个宝宝是可以保留的，但需要密切注意胎儿的发育情况。祝愿您和您的宝宝健康、好运！